• 期刊首页
  • 概况简介
  • 期刊导读
  • 投稿须知
  • 邮箱投稿
  • 在线投稿
  • 联系我们

栏目导航

期刊介绍
概况简介
期刊导读
投稿须知
邮箱投稿
在线投稿

科研进展

  • 微生物所高福课题组在广谱性...
  • 微生物所高福院士就冠状病毒...
  • 全国首届真菌感染与宿主免疫...
  • 第六届传染病防控基础研究与...
  • 郭惠珊课题组在CMV非编码卫星...

通知公告

  • 关于2015级博士研究生提供接...
  • 中国科学院微生物研究所接收...
  • 中国科学院微生物研究所第十...
  • 中国微生物学会第十五届微生...
  • 中国微生物学会第十五届微生...

您现在所在位置:首页 > 期刊导读 > 2011 > 01 > 信息摘要

马铃薯腐烂茎线虫L型半胱氨酸蛋白酶新基因(Dd-cpl-1)的克隆与序列分析

【出 处】:

【作 者】:

【摘 要】L型半胱氨酸蛋白酶基因(Cathepsin L-like cysteine proteinase gene)为与植物寄生线虫寄生能力相关的多功能基因。运用RT-PCR和RACE的方法从马铃薯腐烂茎线虫Ditylenchus destructor中克隆出1个L型半胱氨酸蛋白酶新基因Dd-cpl-1(GenBank登录号为GQ180107)。该基因Dd-cpl-1 cDNA全长序列含有1个1 131 bp的开放性阅读框(ORF),编码376个氨基酸残基,其5′末端及3′末端分别含有29 bp和159 bp的非编码区(UTR)。Dd-cpl-1内含子外显子结构分析结果表明,其基因组序列包含7个内含子,且各内含子两端剪接位点序列遵守GT/AG规则。Dd-cpl-1基因推定的蛋白Dd-CPL-1与松材线虫L型半胱氨酸蛋白酶高度同源,一致性达到77%。以不同物种中L型半胱氨酸蛋白酶氨基酸序列进行比对分析,推测推定的蛋白Dd-CPL-1含有L型半胱氨酸蛋白酶基因家族高度保守的催化三联体(Cys183,His322和Asn343)以及ERFNIN基系和GNFD基系。半胱氨酸蛋白酶系统发育分析表明,Dd-cpl-1属于由L型半胱氨酸蛋白酶组成的进化分支。Dd-cpl-1的这些序列特征进一步表明其为L型半胱氨酸蛋白酶基因。这是首次在马铃薯腐烂茎线虫中克隆到的L型半胱氨酸蛋白酶,为今后在蛋白水平对其进行进一步的功能分析提供基础。

相关热词搜索: 马铃薯腐烂茎线虫 L型半胱氨酸蛋白酶 Dd-cpl-1

上一篇:激素对转基因雪莲毛状根植株再生及类黄酮产生的影响
下一篇:絮凝酵母吸附Cr(VI)的机理

        中国科学院微生物研究所《生物工程学报》
        地址:北京朝阳区北辰西路1号院3号中科院微生物研究所B401  
       邮编:100101